במשרד הפנים מסבירים כי עמק האלה הינו מרחב ייחודי הכולל מגוון אתרי טבע ותרבות מהמעניינים בארץ. מדובר במכלול נופי מרתק הכולל פארקים ושמורות, אתרים ארכיאולוגים, בוסתנים, צמחיית חורש ים-תיכוני ואוכלוסיית בעלי-חיים עשירה.
בצפון השטח נמצא מוקד משיכה חשוב מבחינה ארכיאולוגית, היסטורית ותרבותית: חירבת קייפא. האתר, שנחפר לאחרונה, הינו בעל חשיבות גדולה להבנת תקופת המקרא ומזוהה ע"י החוקרים כעיר שעריים המקראית, המוזכרת בסיפור דוד וגוליית.
ממשרד הפנים נמסר שהתכנית הינה חלק מראייה כוללת למרחב דרום בית שמש, בו אושרו לאחרונה אלפי יחידות דיור.
הוועדה בחנה בכובד ראש את התנגדויות אשר הוגשו לתכנית והחליטה לקבל את חלקן ולתת תוקף לתכנית. בהחלטתה, ציינה הוועדה כי קביעת גן לאומי בעמק האלה מאפשרת לשמור ולהגן על האזור כמכלול נוף ומורשת ייחודי.
